tentang usus dan penelitian tentang mikroba
tentang usus dan penelitian tentang mikroba
Pergi dengan usus AndaPenelitian menyoroti bagaimana mikroba dapat berinteraksi dengan obatcientists
sudah bekerja untuk mengembangkan pengobatan yang dapat disesuaikan
dengan genetika individu, tapi bagaimana menyesuaikan perawatan
berdasarkan genetika dari triliunan mikroba yang hidup dalam usus
seseorang?
Idenya mungkin tidak terlalu mengada-ada seperti kedengarannya, kata Peter Turnbaugh, Fellow Bauer di Fakultas Harvard Seni dan Ilmu Pengetahuan (FAS) Pusat Sistem Biologi.
Dalam sebuah makalah yang baru-baru ini di Cell, Turnbaugh dan co-penulis Corinne Ferrier Maurice dan Henry Joseph Haiser, baik rekan postdoctoral di Pusat untuk Sistem Biologi, menunjukkan bahwa, sebagai obat yang diberikan, aktivitas mikroba usus manusia dapat berubah secara dramatis. Memahami bagaimana perubahan tersebut mempengaruhi obat bisa satu hari membantu peneliti untuk merancang obat yang bekerja lebih efektif dan antibiotik yang lebih spesifik patogen sasaran.
"Pertanyaan besar adalah:? Sampai sejauh mana manfaat dan efek samping dari berbagai jenis obat tergantung pada mikroba dalam usus kita" Turnbaugh kata. "Selama beberapa dekade, kami tahu mereka bisa memainkan beberapa peran. Mikroba mendiami usus kita mampu mengubah struktur obat dengan cara yang dapat berkontribusi terhadap toksisitas, atau mengaktifkan atau menonaktifkan senyawa. Dalam hampir semua kasus, namun, kami tidak tahu mikroba tertentu yang bertanggung jawab, gen mereka mungkin menggunakan, atau faktor-faktor yang mendukung atau menghambat kegiatan ini. "
Sebelumnya, Maurice dan Haiser bisa meneliti bagaimana mikroba dalam usus bereaksi terhadap berbagai pengobatan. Namun, mereka ingin tahu persis mana mikroba berada di sana, dan apakah semua sama-sama aktif.
Untuk mendapatkan pertanyaan itu, mereka beralih ke teknik yang dipinjam dari air mikroba ekologi.
Mereka pertama kali ditandai dengan sel serangkaian tiga noda dirancang untuk menyoroti apakah dan bagaimana sel-sel yang rusak parah, dan seberapa aktif sel-sel yang, berdasarkan jumlah DNA dan RNA mereka mengandung. Menggunakan cytometer aliran, sebuah perangkat yang menggunakan laser untuk menghitung dan menyortir sel tepatnya, mereka dapat menentukan berapa banyak dari setiap jenis sel yang hadir dalam sampel.
"Tampilan awal kami menunjukkan bahwa mikrobiota usus relatif cukup aktif dengan lingkungan lainnya, dan ada juga persentase yang besar - sekitar 30 persen - sel yang rusak," kata Turnbaugh. "Kami juga menemukan bahwa kedua kelompok aktif dan rusak yang terutama terdiri dari Firmicutes, salah satu dari dua kelompok utama bakteri dalam usus. Itu menunjukkan bahwa Firmicutes mungkin lebih sangat aktif dari anggota lain dari komunitas mikroba usus kita. "
Berbekal data itu, peneliti menggunakan sequencing generasi berikutnya untuk mempelajari bagaimana ekspresi gen dari bakteri berubah sebagai obat enam dan delapan antibiotik diberikan.
"Kita tahu bahwa setidaknya beberapa anggota masyarakat dapat mengubah obat ini. Harapan kami adalah bahwa menemukan perubahan dalam ekspresi gen akan memberi kita petunjuk mengenai siapa yang bertanggung jawab dan gen mereka mungkin menggunakan apa, "kata Turnbaugh. "Kami mampu mengidentifikasi berbagai perubahan dalam ekspresi gen, banyak dari mereka konsisten dengan perubahan biokimia yang dikenal untuk masing-masing senyawa, memberikan titik awal untuk penelitian lebih mekanistik."
Untuk berbagai antibiotik yang mereka uji, Turnbaugh mengatakan, rekan terkejut melihat respon yang berbeda antara individu dan untuk setiap individu pada hari yang berbeda.
"Tujuan utama dari antibiotik untuk menghilangkan bakteri patogen, tapi kami belajar bahwa ada banyak efek samping yang obat ini terhadap mikroba yang biasanya ditemukan dalam usus, yang dapat memiliki konsekuensi negatif," katanya. "Telah ada banyak penekanan pada obat pribadi dalam beberapa tahun terakhir, dan cara standar memikirkan yang memahami genom manusia dan mencoba untuk memprediksi bagaimana obat yang diberikan akan bereaksi dalam tubuh Anda. Saya pikir makalah ini menekankan bahwa mungkin sama pentingnya untuk berpikir tentang bagaimana mikrobiota usus tertentu Anda akan berinteraksi dengan obat yang diberikan. "
Idenya mungkin tidak terlalu mengada-ada seperti kedengarannya, kata Peter Turnbaugh, Fellow Bauer di Fakultas Harvard Seni dan Ilmu Pengetahuan (FAS) Pusat Sistem Biologi.
Dalam sebuah makalah yang baru-baru ini di Cell, Turnbaugh dan co-penulis Corinne Ferrier Maurice dan Henry Joseph Haiser, baik rekan postdoctoral di Pusat untuk Sistem Biologi, menunjukkan bahwa, sebagai obat yang diberikan, aktivitas mikroba usus manusia dapat berubah secara dramatis. Memahami bagaimana perubahan tersebut mempengaruhi obat bisa satu hari membantu peneliti untuk merancang obat yang bekerja lebih efektif dan antibiotik yang lebih spesifik patogen sasaran.
"Pertanyaan besar adalah:? Sampai sejauh mana manfaat dan efek samping dari berbagai jenis obat tergantung pada mikroba dalam usus kita" Turnbaugh kata. "Selama beberapa dekade, kami tahu mereka bisa memainkan beberapa peran. Mikroba mendiami usus kita mampu mengubah struktur obat dengan cara yang dapat berkontribusi terhadap toksisitas, atau mengaktifkan atau menonaktifkan senyawa. Dalam hampir semua kasus, namun, kami tidak tahu mikroba tertentu yang bertanggung jawab, gen mereka mungkin menggunakan, atau faktor-faktor yang mendukung atau menghambat kegiatan ini. "
Sebelumnya, Maurice dan Haiser bisa meneliti bagaimana mikroba dalam usus bereaksi terhadap berbagai pengobatan. Namun, mereka ingin tahu persis mana mikroba berada di sana, dan apakah semua sama-sama aktif.
Untuk mendapatkan pertanyaan itu, mereka beralih ke teknik yang dipinjam dari air mikroba ekologi.
Mereka pertama kali ditandai dengan sel serangkaian tiga noda dirancang untuk menyoroti apakah dan bagaimana sel-sel yang rusak parah, dan seberapa aktif sel-sel yang, berdasarkan jumlah DNA dan RNA mereka mengandung. Menggunakan cytometer aliran, sebuah perangkat yang menggunakan laser untuk menghitung dan menyortir sel tepatnya, mereka dapat menentukan berapa banyak dari setiap jenis sel yang hadir dalam sampel.
"Tampilan awal kami menunjukkan bahwa mikrobiota usus relatif cukup aktif dengan lingkungan lainnya, dan ada juga persentase yang besar - sekitar 30 persen - sel yang rusak," kata Turnbaugh. "Kami juga menemukan bahwa kedua kelompok aktif dan rusak yang terutama terdiri dari Firmicutes, salah satu dari dua kelompok utama bakteri dalam usus. Itu menunjukkan bahwa Firmicutes mungkin lebih sangat aktif dari anggota lain dari komunitas mikroba usus kita. "
Berbekal data itu, peneliti menggunakan sequencing generasi berikutnya untuk mempelajari bagaimana ekspresi gen dari bakteri berubah sebagai obat enam dan delapan antibiotik diberikan.
"Kita tahu bahwa setidaknya beberapa anggota masyarakat dapat mengubah obat ini. Harapan kami adalah bahwa menemukan perubahan dalam ekspresi gen akan memberi kita petunjuk mengenai siapa yang bertanggung jawab dan gen mereka mungkin menggunakan apa, "kata Turnbaugh. "Kami mampu mengidentifikasi berbagai perubahan dalam ekspresi gen, banyak dari mereka konsisten dengan perubahan biokimia yang dikenal untuk masing-masing senyawa, memberikan titik awal untuk penelitian lebih mekanistik."
Untuk berbagai antibiotik yang mereka uji, Turnbaugh mengatakan, rekan terkejut melihat respon yang berbeda antara individu dan untuk setiap individu pada hari yang berbeda.
"Tujuan utama dari antibiotik untuk menghilangkan bakteri patogen, tapi kami belajar bahwa ada banyak efek samping yang obat ini terhadap mikroba yang biasanya ditemukan dalam usus, yang dapat memiliki konsekuensi negatif," katanya. "Telah ada banyak penekanan pada obat pribadi dalam beberapa tahun terakhir, dan cara standar memikirkan yang memahami genom manusia dan mencoba untuk memprediksi bagaimana obat yang diberikan akan bereaksi dalam tubuh Anda. Saya pikir makalah ini menekankan bahwa mungkin sama pentingnya untuk berpikir tentang bagaimana mikrobiota usus tertentu Anda akan berinteraksi dengan obat yang diberikan. "
Categories:
Obat Alami
0 comments:
Post a Comment